U Sudu Bosne i Hercegovine, Šerif Patković izjasnio se da nije kriv za ratni zločin počinjen u selu Dusina kod Zenice u siječnju 1993. godine. Optužnica ga tereti kao zapovjednika Drugog bataljona Sedme muslimanske brigade Armije BiH za zločin protiv ratnih zarobljenika, uključujući ubojstvo ranjenog zapovjednika Hrvatskog vijeća obrane (HVO), Zvonke Rajića, koji je, prema optužnici, ležao onesposobljen na zemlji kada je lišen života.
Prema ranijim izvješćima Suda BiH, Patković je optužen za kršenje Ženevskih konvencija o zaštiti ratnih zarobljenika, dok svjedočenja preživjelih mještana Dusine ukazuju na niz zločina koje su počinile postrojbe pod njegovim zapovjedništvom.
Dokumentacija Drugog bataljuna Sedme muslimanske brigade Armije RBiH prema svjedočenjima prikazuje prisutnost mudžahedinskih taktičkih grupa koje su sudjelovale u napadima na hrvatsko stanovništvo od Vareša do Fojnice.
Pogledajte prilog RTV HB od 16. rujna ove godine.
Patkovićevo ime dodatno je izazvalo pozornost nakon što se pojavio na propalestinskom prosvjedu u Zenici, gdje je usporedio Hamas s muslimanskom brigadom Armije BiH te najavio spremnost na angažman za ovu organizaciju, što je popraćeno aplauzom okupljenih.
Skupu je prisustvovao i veleposlanik Palestine u BiH Rezeq Namoora, a Patković je javno kritizirao prisutnost Sjedinjenih Američkih Država i izraelske vojske na Bliskom istoku.